Durante su segunda jornada en el país sudamericano, la agenda del Pontífice incluyó encuentros con jóvenes y con víctimas de abusos dentro de la Iglesia. Asimismo, León XIV ofreció un discurso sobre los desafíos éticos del desarrollo científico y tecnológico, advirtiendo que la ciencia y la tecnología no siempre son neutrales y que el progreso pierde sentido si olvida la justicia y a los más vulnerables.
En paralelo a los actos litúrgicos y académicos, la visita papal generó tensiones políticas locales. Tras un discurso en el Estadio Nacional donde el arzobispo de Lima, cardenal Carlos Castillo, recordó a dos jóvenes fallecidos durante las protestas de 2020, la senadora Martha Chávez, del partido Fuerza Popular, criticó públicamente al jerarca eclesiástico a través de redes sociales.
